Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms