Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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