Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms