Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms