Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Tmod2Q9JKK7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Tmod2Q9JKK7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod2Q9JKK7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Tmod2Q9JKK7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod2Q9JKK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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Tmod2Q9JKK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms