Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms