Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim39Q9ESN2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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