Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne8Q9DC53 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms