Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms