Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms