Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx17Q9D0I4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms