Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn2Q9CQS6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms