Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Nicn1Q9CQM0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nicn1Q9CQM0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms