Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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