Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q99LU8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99LU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99LU8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms