Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam20bQ8VCS3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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