Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxapQ8VCG9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms