Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms