Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
9030612E09RikQ8CE20 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms