Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms