Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna2Q61301 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna2Q61301 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms