Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r195Q5SVD6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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