Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf12Q5SPL2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms