Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv2-2Q5R1A4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms