Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf2Q5NC05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms