Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms