Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms