Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U1D9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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