Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam107bQ3TGF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam107bQ3TGF2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam107bQ3TGF2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam107bQ3TGF2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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