Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb33Q30KN3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms