Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms