Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad23aP54726 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms