Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms