Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa10P31310 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa10P31310 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms