Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxrgP28705 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms