Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms