Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms