Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5r2O35926 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms