Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms