Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3415J3QMS8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms