Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17555F6U8B9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms