Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf212F6TQD1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf212F6TQD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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