Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Defa35E9QLQ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Defa35E9QLQ1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Defa35E9QLQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Defa35E9QLQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Defa35E9QLQ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa35E9QLQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms