Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms