Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms