Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms