Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms