Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SIX1Q15475 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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SIX1Q15475 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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SIX1Q15475 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SIX1Q15475 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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