Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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