Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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